در این آزمایشگاه، محققان و دانشجویان شیمی دارویی واکنش های آلی لازم جهت سنتز و دست یافتن به ترکیبات هدف با خواص بالقوه دارویی را انجام می دهند. این آزمایشگاه دارای حدود ۸۰ مترمربع فضای فیزیکی بوده که مجهز به سه هود قوی، اگزوز فن، گردش هوا، زنگ هشدارآتش، کپسول های اطفا حریق، یخچال و فریزر، دستگاه سختی گیر آب و غیره می باشد. همچنین این آزمایشگاه با دستگاه های مختلف و پرکاربرد در آزمایشگاهای شیمی شامل روتاری، دستگاه نقطه ذوب، آونهای معمولی و خلاء، pH متر، دستگاه اولتراسوند، همزن های مغناطیسی، شوف بالن، شیکر، پمپ های خلاء، شیشه آلات آزمایشگاهی و غیره مجهز شده است.
